糸状菌関連ゲノムデータベース
  • 製品評価技術基盤機構（NITE）の麹菌ゲノムデータベース(DOGAN)
  • 麹菌の遺伝子がAO090から始まるGene IDで登録されており、これらの配列に対してBLAST検索することができる。
  • Aspergillus oryzae Genome Database (RIB40) in DOGAN (Genome Database in Database Of Genomes Analyzed by NITE)
  • http://www.bio.nite.go.jp/dogan/MicroTop?GENOME_ID=ao
  • 酒類総合研究所(NRIB)の麹菌ゲノムデータベース
  • 麹菌の遺伝子がAO080から始まるGene IDで登録されており、DOGANより登録遺伝子数が多く、一部遺伝子予測領域が違うので、DOGANで目的の遺伝子が見つからなかった際にはこちらでBLAST検索するとよい。
  • [方法] 最初の画面のリストより、Aspergillus oryzae RIB40(NRIB)　aor0-1を選択する。 Ortholog infoのタグでDOGANのAO090から始まるGene IDとの対応や、他の糸状菌や酵母の遺伝子とのオーソログ関係を参照することができる。
  • Expression InfoのタブのSOLiD RNA-Seq[View map]をクリックするとRNA配列を見ることができ、イントロンや5'-, 3'-UTRの情報が取得できる。
  • NRIB : Comparative Fungal Genome Database
  • http://nribf21.nrib.go.jp/CFGD/prj.cgi?prj=02201
  • Aspergillus属の比較ゲノムデータベース
  • 7種類のAspergillus属糸状菌のゲノムデータベースに対してBLAST検索ができる。
  • Aspergillus Comparative Database in /lioad Institute
  • http://www.broadinstitute.org/annotation/genome/aspergillus_group/MultiHome.html
  • Aspergillus属糸状菌の遺伝子データベース
  • 8種類のAspergillus属糸状菌の遺伝子機能に関する情報が得られる。
  • Central Aspergillus Data REpository (CADRE)
  • http://www.cadre-genomes.org.uk/
  • Aspergillus属のゲノムデータベース
  • 4種類のAspergillus属のゲノム情報が取得できる
  • Aspergillus Genome Database
  • http://www.aspgd.org/
  • 出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeのゲノムデータベース
  • http://www.yeastgenome.org/
  • このデータベース内の以下のサイトでは、Aspergillus属に限らず様々な糸状菌のゲノムデータベースに対してBLAST検索ができる。
  • http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/blast-fungal.pl
  • その他
  • 糸状菌全般の有用な情報が入手できるサイト
  • Fungal Genetics Stock Center
  • http://www.fgsc.net/