2025
- Chao-Nan Wang, Yoko Masuda, Keishi Senoo (2025).
Ammonium Generating Microbial Consortia via Reductive Nitrogen Transformation in Paddy Soil Revealed by the Combination of DNA-Stable Isotope Probing and Metatranscriptomics.
Microorganisms, 13(7), 1448. doi:10.3390/microorganisms13071448
水田土壌において還元的窒素変換反応によってアンモニアを生成する微生物群集を安定同位体プローブ法とメタトランスクリプトーム解析を用いて明らかにしました。 - Kazumori Mise, Yoko Masuda, Keishi Senoo, Hideomi Itoh (2025).
Betaproteobacterial clade II nosZ activated under high N₂O concentrations in paddy soil microcosms.
Journal of Applied Microbiology, Volume 136, Issue 3, March 2025. doi: 10.1093/jambio/lxaf055
水田土壌において温室効果ガスN₂Oの吸収に機能している可能性のある微生物群を土壌ミクロコズムを用いて特定しました。 - Li‑Yen Lin, Zhihang Feng, Hikaru Asano, Yoshihiro Ohmori, Hirotomo Ohba, Yoko Masuda, Keishi Senoo, Toru Fujiwara (2025).
Genome-wide association study identifies key chromosomal regions in rice promoting the enrichment of diazotrophic iron-reducing bacteria in paddy soil.
Plant Soil, published online 28 March 2025. doi: https://doi.org/10.1007/s11104-025-07384-9
水田土壌の鉄還元窒素固定菌の増殖促進に関わるイネ染色体の鍵領域を同定しました。
- 著書妹尾啓史．水田土壌での鉄還元菌チッソ固定の発見とその増強技術．Inみんなの有機農業技術大事典 共通技術編 農文協
- 著書妹尾啓史．水田土壌での鉄還元菌チッソ固定の発見とその増強技術．In最新農業技術 土壌施肥 vol.17（pp.10-15）農文協
- 著書Haoyang Shen, Keishi Senoo. Mesofaunal health matters: Mites reduce fungal N₂O emissions from soils under agriculture. In “Nitrogen Cycling and Soil Health”. pp.59-71, Hatano, R. and E. M. Baggs (Eds), Springer Nature Publisher
- 著書Yoko Masuda, Weishou Shen, Keishi Senoo. Discovery of previously overlooked microbial drivers of nitrogen fixation in paddy soil, iron-reducing bacteria, and application to low nitrogen input agriculture. In “Nitrogen Cycling and Soil Health”. pp.39-57, Hatano, R. and E. M. Baggs (Eds), Springer Nature Publisher
2024
- Zhenxing Xu, Shohei Hattori, Yoko Masuda, Sakae Toyoda, Keisuke Koba, Pei Yu, Naohiro Yoshida, Zong-Jun Du, Keishi Senoo (2024).
Unprecedented N₂O production by nitrate-ammonifying Geobacteraceae with distinctive N₂O isotopocule signatures.
mBio. doi: https://doi.org/10.1128/mbio.02540-24
硝酸をアンモニウムに還元する能力を持つ水田土壌細菌による温室効果ガスN₂O生成の新たな経路を明らかにしました。 - Yoko Masuda, Mitsutaka Chihara, Keishi Senoo (2024).
Ferrihydrite Addition Activated Geobacteraceae, the Most Abundant Iron-reducing Diazotrophs, and Suppressed Methanogenesis by Heterogeneous Methanogens in Xylan-amended Paddy Soil Microcosms.
Microbes Environ., 39(3). doi: 10.1264/jsme2.ME24028
水田土壌への酸化鉄の添加が鉄還元窒素固定菌を活性化すると同時にメタン生成を抑制することを示しました。 - Yoko Masuda, Kazumori Mise, Zhenxing Xu, Zhengcheng Zhang, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo, Hideomi Itoh (2024).
Global soil metagenomics reveals distribution and predominance of Deltaproteobacteria in nitrogen-fixing microbiome.
Microbiome, 12, 95. doi: 10.1186/s40168-024-01812-1
地球規模の土壌メタゲノム解析から、我々が近年発見した窒素固定細菌(Deltaproteobacteria綱に属するAnaeromyxobacteraceaeとGeobacteraceae科細菌)が地球上の様々な土壌に普遍的に生息しており、特に水田土壌や底質のような嫌気的な環境の土壌において優占していることを明らかにしました。 - 増田曜子, 妹尾啓史(2024)．鉄で土を肥やす. 科学 第94巻第2号（2024年2月号）；p147-151. 岩波書店
2023
- Hideomi Itoh, Yumi Sugisawa, Kazumori Mise, Zhenxing Xu, Miyu Kuniyasu, Natsumi Ushijima, Keisuke Kawano, Emiko Kobayashi, Yutaka Shiratori, Yoko Masuda and Keishi Senoo (2023). Mesoterricola silvestris gen. nov., sp. nov., Mesoterricola sediminis sp. nov., Geothrix oryzae sp. nov., Geothrix edaphica sp. nov., Geothrix rubra sp. nov., and Geothrix limicola sp. nov., six novel members of Acidobacteriota isolated from soils. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 73, 006073. doi: 10.1099/ijsem.0.006073
- 増田曜子 (2023). 水田土壌メタトランスクリプトミクス —窒素・炭素循環を駆動する土壌微生物群の真相解明—. 日本土壌肥料学雑誌, 94(4), 301-306. doi: 10.1007/s00203-023-03631-8
- 妹尾啓史, 増田曜子 (2023). 講座 理想の農業を追求する —サステイナブルで革新的な食糧生産を支える基礎研究と現場技術— 1. 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と低窒素農業への応用の試み —オミクス解析からサステイナブル農業へ—. 日本土壌肥料学雑誌, 94(3), 216-222
- 藤原徹, 林健太郎, 中島亨, 加藤拓, 妹尾啓史, 増田曜子, Shen Haoyang, Xu Zhenxing, Zhang Zhengcheng, 山中遥加, 佐藤咲良, 伊藤英臣, 白鳥豊, 大峽広智, 小暮敏博, 高橋嘉夫, Shen Weishou, 柳澤修一, 樋口恭子 (2023). 地球温暖化に対処する土壌肥料学. 日本土壌肥料学雑誌, 94(3), 230-235
- Yoko Masuda, Sakura Satoh, Ryota Miyamoto, Ryo Takano, Katsuhiro Ishii, Hirotomo Ohba, Yutaka Shiratori, and Keishi Senoo (2023).
Biological nitrogen fixation in the long-term nitrogen-fertilized and unfertilized paddy fields, with special reference to diazotrophic iron-reducing bacteria. Archives of Microbiology 205, 291. doi: 10.1007/s00203-023-03631-8
35年間、窒素肥料を施用しないで水稲を栽培し続けてきた水田および、窒素肥料を施用して水稲を栽培し続けてきた水田のいずれにおいても、私達が近年発見した鉄還元窒素固定菌が土壌で窒素固定を担っている主要な微生物であり、土壌の窒素肥沃度と水稲収量の維持に貢献していることが示されました。 - Zhengcheng Zhang, Yoko Masuda, Zhenxing Xu, Yutaka Shiratori, Hirotomo Ohba and Keishi Senoo (2023).
Active Nitrogen Fixation by Iron-Reducing Bacteria in Rice Paddy Soil and Its Further Enhancement by Iron Application. Applied Sciences, 13(14), 8156. doi: 10.3390/app13148156
水田土壌において鉄還元菌が活発に窒素固定を行っており、鉄施用によってさらに増強できることを示しました。 - Haoyang Shen, Tadashi Nagamine, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo (2023). Enhanced mite grazing leads to pattern shifts in soil N₂O emissions after organic fertilizer application. Soil Biology and Biochemistry, 181, 109027. doi: 10.1016/j.soilbio.2023.109027
- 増田曜子 (2023). メタトランスクリプトーム解析による水田土壌微生物の新機能発見とその応用ーメタン生成・消去や窒素固定を担う微生物ー. 作物生産と土づくり2023･24年 12･1月号, p59-64. 一般財団法人日本土壌協会
- 増田曜子 (2023). 鉄で土を肥やす！鉄還元に伴う窒素固定の発見. 新潟アグロノミー 第56号, p2-13. 新潟県土壌肥料懇話会
- 妹尾啓史 (2023). 農耕地からの温室効果ガス排出の削減戦略. アグリバイオ 第7巻第12号(2023年11月), p6-8. 北隆館
- 妹尾啓史 (2023). 土壌微生物と土壌動物を活用して農耕地からのN₂O排出を削減し作物生産性を向上する. アグリバイオ 第7巻第12号(2023年11月), p29-34. 北隆館
- 妹尾啓史, 大峽広智 (2023). 鉄で土を肥やす：水田土壌の鉄還元菌窒素固定の増強による低窒素肥料水稲生産. 作物生産と土づくり2022･23年 12･1月号, p16-20. 一般財団法人日本土壌協会
2022
- Hideomi Itoh, Zhenxing Xu, Kazumori Mise, Yoko Masuda, Natsumi Ushijima, Chie Hayakawa, Yutaka Shiratori and Keishi Senoo (2022). Anaeromyxobacter oryzae sp. nov., Anaeromyxobacter diazotrophicus sp. nov. and Anaeromyxobacter paludicola sp. nov., isolated from paddy soils. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 72(10), 005546. doi: 10.1099/ijsem.0.005546
- Weishou Shen, Yaou Long, Zijian Qiu, Nan Gao, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Hirotomo Ohba, Yutaka Shiratori, Adharsh Rajasekar, Keishi Senoo (2022).
Investigation of Rice Yields and Critical N Losses from Paddy Soil under Different N Fertilization Rates with Iron Application. Int. J. Environ. Res. Public Health, 19(14), 8707. doi: 10.3390/ijerph19148707
水田において窒素施肥量を減らすことにより窒素の環境への流出が抑えられ、水稲収量の減少は鉄の施用により緩和されることを示しました。
- 妹尾啓史 (2022). チッソ固定の新たな役者 鉄還元細菌が田んぼを肥やす. 別冊現代農業2022年10月号, p88-91. 農山漁村文化協会
2021
- Yoko Masuda,Yutaka Shiratori,Hirotomo Ohba,Takanori Ishida,Ryo Takano,Sakura Satoh,Weishou Shen,Nan Gao,Hideomi Itoh, Keishi Senoo (2021).
Enhancement of the nitrogen-fixing activity of paddy soils owing to iron application. Soil Sci. Plant Nutr., 67(3), 243-247. doi: 10.1080/00380768.2021.1888629
鉄の施用により水田土壌の窒素固定活性を強化できることを実証しました。 - Haoyang Shen, Yutaka Shiratori, Sayuri Ohta, Yoko Masuda, Kazuo Isobe, Keishi Senoo (2021).
Mitigating N₂O emissions from agricultural soils with fungivorous mites. ISME J., 15, 2427-2439. doi: 10.1038/s41396-021-00948-4
菌食性土壌動物がN₂O生成糸状菌を摂食することにより畑土壌からのN₂O排出が削減されました。 - Wei Wei, Kazuo Isobe, Yutaka Shiratori, Midori Yano, Sakae Toyoda, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Haoyang Shen, Keishi Senoo (2021).
Revisiting the involvement of ammonia oxidizers and denitrifiers in nitrous oxide emission from cropland soils. Environ. Pollut., 287, 117494. doi: 10.1016/j.envpol.2021.117494
有機質肥料や化学肥料を施用した土壌におけるN₂O生成の微生物プロセスを明らかにしました。 - Zhengcheng Zhang, Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Xueding Wang, Natsumi Ushijima, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo, Hideomi Itoh (2021). Geomesophilobacter sediminis gen. nov., sp. nov., Geomonas propionica sp. nov. and Geomonas anaerohicana sp. nov., three novel members in the family Geobacterecace isolated from river sediment and paddy soil. Syst. Appl. Microbiol., 44(5), 126233. doi: 10.1016/j.syapm.2021.126233
- Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Xueding Wang, Natsumi Ushijima, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo, Hideomi Itoh (2021). Genome-based taxonomic rearrangement of the order Geobacterales including the description of Geomonas azotofigens sp. nov. and Geomonas diazotrophica sp. nov.. Front. Microbiol., 12, 737531. doi: 10.3389/fmicb.2021.737531
- 妹尾啓史 (2021). 水田土壌における窒素固定の新たな役者「鉄還元菌」の発見と低窒素肥料農業への応用. 作物生産と土づくり, 2021年 2・3月号, 51-55.
- 妹尾啓史・増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊・大峽広智・Xu Zhenxing・山中遥加・石田敬典・髙野諒・佐藤咲良・Shen Weishou (2021). 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の学術的基盤解明と低窒素農業への応用：低炭素社会の実現を目指して. 土と微生物, 75, 60-65.
- 妹尾啓史・大峽広智 (2021). 鉄で土を肥やす～水田土壌における窒素固定の新たな役者「鉄還元菌」の発見と応用～. 肥料時報, 482, 7-31.
2020年以前
- Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Zhen-Xing Xu, Yutaka Shiratori, Toshihiro Aono, Seigo Amachi, Keishi Senoo, Hideomi Itoh (2020).
Diazotrophic Anaeromyxobacter isolates from soils.. Appl. Environ. Microbiol., 86(16), e00956-20. doi: 10.1128/AEM.00956-20
土壌から分離した鉄還元菌Anaeromyxobacterの窒素固定能を初めて証明しました。 - Reiko Fujimura, Yoichi Azegami, Wei Wei, Hiroko Kakuta, Yutaka Shiratori, Nobuhito Ohte, Keishi Senoo, Shigeto Otsuka, Kazuo Isobe (2020).
Distinct community composition of previously uncharacterized denitrifying bacteria and fungi across different land-use types. Microbes. Environ., 35(1), ME19064. doi: doi.org/10.1264/jsme2.ME19064
土地利用タイプによって土壌の脱窒微生物群集が異なり、これまでに知られていなかった特徴的な分類群が存在していることを明らかにしました。 - Yoko Masuda,Takashi Matsumoto,Kazuo Isobe, Keishi Senoo (2019).
Denitrification in paddy soil as a cooperative process of different nitrogen oxide reducers, revealed by metatranscriptomic analysis of denitrification-induced soil microcosm. Soil Sci. Plant Nutr., 65(4), 342-345. doi: 10.1080/00380768.2019.1622401
水田土壌の脱窒反応の各ステップを駆動する微生物群はそれぞれ異なっており、それらが協奏的に働くことで安定した反応が行われることが示唆されました。 - Yoko Masuda,Hideomi Itoh,Yutaka Shiratori, Keishi Senoo (2018).
Metatranscriptomic insights into microbial consortia driving methane metabolism in paddy soils. Soil Sci. Plant Nutr., 64(4), 455-464. doi: 10.1080/00380768.2018.1457409
水田土壌においてメタンの生成と消去に関わる微生物コンソーシアの全体像をメタトランスクリプトーム解析によって明らかにしました。
- 増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史 (2020). 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用－マイクロバイオーム解析から低窒素農業へ－. 土と微生物, 74, 2-7.
- 増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史 (2020). 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用 オミクス解析から低窒素農業へ. 化学と生物, 58, 143-150..