AIKOM生は東京大学の協定校（AIKOM Partner Schoolsを参照のこと）に在学する学生から選ばれます。現在は23大学から28名の学生を受け入れています。またほぼ同数の駒場キャンパスの学生を協定校に派遣しています。 　応募資格は、協定校の正規の学生で、プログラム参加期間に第3年次・第4年次に在籍していることです。日本語能力は問いませんが、英語を公用語としない国からの学生はTOEFL550PBT／213CBT／80iBT以上の英語力が必要です。学業成績・留学目的・国際的研究交流に対する熱意等が選考の基準となります。 例年４月末ごろに各協定校から候補者が推薦され、応募書類を元に東京大学が最終選考を行います。その後、JASSO(日本学生支援機構)へ奨学生候補として推薦します。